Hallazgos incidentales en medicina genómica / Incidental Findings in Genomic Medicine

Las técnicas de Biología Molecular de última generación, como es la secuenciación masiva en paralelo o NGS (Next Generation Sequencing), permite obtener gran cantidad de información genómica, la cual muchas veces va más allá de la detección de una variante patogénica en un gen que explique la patología (hallazgo primario). Es así como surgió desde hace años la discusión internacional respecto a la decisión a tomar frente a los hallazgos secundarios accionables, es decir, aquellos hallazgos de variantes clasificadas como patogénicas o probablemente patogénicas que no están relacionadas con el fenotipo del paciente, pero que tiene alguna medida preventiva o tratamiento posible y, por lo tanto, podría ser de utilidad para la salud del paciente. Luego de revisar la bibliografía internacional y debatir entre los expertos del Hospital de Pediatría Garrahan, se logró establecer una política institucional y reforzar el hecho de que se trata de una disciplina multidisciplinaria. Así, fue posible definir que solo se atenderá las cuestiones relacionadas con la edad pediátrica, dejando para un tratamiento posterior aquellas variantes detectadas en genes que sean accionables en edad adulta. En el Hospital Garrahan, ha sido posible definir claramente cómo proceder frente a los hallazgos secundarios, al adaptar el consentimiento informado a esta necesidad, definiendo cuándo serán informados, y sabiendo que serán buscados intencionalmente en los genes clínicamente accionables enlistados en la última publicación del American College of Medical Genetics and Genomics, siempre y cuando el paciente/padre/tutor lo consienta (AU)

The latest generation of molecular biology techniques, including massive parallel sequencing or NGS (Next Generation Sequencing), allows us to obtain a whealth of genomic information, which often goes beyond the detection of a pathogenic variant in a gene that explains the pathology (primary finding). As a result, an international discussion has arisen over the years regarding the decision-making concerning actionable secondary findings, it means, those findings of variants classified as pathogenic or probably pathogenic that are not related to the patient's phenotype, but which have some possible preventive measure or treatment and, therefore, could be useful for the patient's health. After reviewing the international literature and discussing among the experts of the Hospital de Pediatría Garrahan, an institutional policy was established and the concept that this is a multidisciplinary discipline was reinforced. Consequently, it has been defined that only issues related to children will be addressed, reserving those variants detected in genes that are actionable in adulthood for later treatment. At Garrahan Hospital, we were able to clearly define how to proceed with secondary findings by adapting the informed consent to this need, defining when they will be reported, and knowing that they will be intentionally searched for in the clinically actionable genes listed in the latest publication of the American College of Medical Genetics and Genomics, as long as the patient/parent/guardian consents (AU)

Progress on Molecular Biology for Forensic Ancestry Inference / 法医学杂志

Forensic ancestry inference refers to the application of ancestry inference of population genetics in forensic practice, which aims to assist police investigation and judicial trial. With the rapid development and extensive use of genomics, DNA as a direct carrier of genetic information, has soon replaced various phenotypic markers and become the main research topics of forensic ancestry inference. This paper reviews different kinds of genetic markers used for forensic ancestry inference, the statistical analysis methods applied, and the prospects of the development in this field.

Clasificación de las enfermedades periodontales: evolución y cambios futuros / Classification of periodontal diseases: evolution and future changes

El propósito de este trabajo es, en primer término, determinar cuales son los factores más importantes en el diagnóstico periodontal; su evolución en el tiempo y cuál sería el futuro en la clasificación de las enfermedades periodontales en base a los avances que se están realizando en biología molecular. Se está trabajando en la investigación de los biomarcadores salivales como predictores de la enfermedad periodontal, un rápido test de saliva podría diagnosticar dicha patología (21, 22, 27, 28, 29). Las clasificaciones van evolucionando a medida que se conoce más sobre estasenfermedades (2). Aún falta mucha investigación para poder realizar una clasificación basada en la etiología (2).La biología molecular parece ser muy prometedora, ya que podríamos ser másespecíficos en la etiología de la enfermedad y esclarecer muchas de nuestras incertidumbres (21)

The purpose of this essay is to determine which are the most importantfactors in the periodontal diagnosis, its evolution in time and also determinewhich would be the future classification of periodontal diseases based on theadvances being made in molecular biology.Even today determining the causes of periodontal disease remains a complexmatter.Work is being done today in the research of salivary biomarkers as predictorsof periodontal desease, through rapid saliva test could diagnose thisdisease.21, 22, 27, 28, 29Classifications are evolving as we know more about this disease.2There is still way more research to be made in order to be able to establisha classification based in etiology.2Molecular biology seems to be very promising in that we can be more specificin the etiology of the disease and clarify many of our uncertainties.

Adaptation and validation of indicators concerning the sterilization process of supplies in Primary Health Care services / Adaptação e validação de indicadores para o processamento de produtos na atenção primária à saúde / Adaptación y validación de indicadores para el procesamiento de productos en la atención primaria a la salud

OBJECTIVES: to adapt and validate, by expert consensus, a set of indicators used to assess the sterilization process of dental, medical and hospital supplies to be used in PHC services. METHOD: qualitative methodological study performed in two stages. The first stage included a focal group composed of experts to adapt the indicators to be used in PHC. In the second stage, the indicators were validated using a 4-point Likert scale, which was completed by judges. A Content Validity Index of ≥ 0.75 was considered to show approval of the indicators. RESULTS: the adaptations implemented by the focal group mainly referred to the physical structure, inclusion of dental care professionals, inclusion of chemical disinfection, and replacement of the hot air and moist heat sterilization methods. The validation stage resulted in an index of 0.96, which ranged from 0.90 to 1.00, for the components of the indicators. CONCLUSION: the judges considered the indicators after adaptation to be validated. Even though there may be differences among items processed around the world, there certainly are common characteristics, especially in countries with economic and cultural environments similar to Brazil. The inclusion of these indicators to assess the safety of healthcare supplies used in PHC services should be considered. .

OBJETIVOS: adaptar e validar para o uso no âmbito da APS, por meio de consenso de especialistas, um conjunto de indicadores para avaliação do processamento de artigos odonto-médico-hospitalares. MÉTODO: estudo metodológico quantitativo, realizado em duas fases subsequentes. Na primeira fase, um grupo focal foi desenvolvido com especialistas, a fim de adaptar os indicadores para uso em Atenção Primária em Saúde. Na segunda fase, os indicadores foram submetidos à validação pelos juízes, através de uma escala tipo Likert de 4 pontos, considerando-se Índice de Validade de Conteúdo ≥0,75 para aprovação dos indicadores. RESULTADOS: as adaptações do grupo focal foram principalmente quanto à: estrutura física, inserção de profissionais de odontologia, inclusão de desinfecção química e substituição de métodos de esterilização por calor seco por calor úmido. A fase de validação resultou num total de 0,96 de índice para os componentes dos indicadores, variando 0,90-1,00. CONCLUSÃO: após adaptação os indicadores foram considerados validados pelos juízes. Embora haja diferença entre os produtos de processamento em todo o mundo, certamente características comuns podem ser encontradas, principalmente em países com ambiente econômico e cultural similares. Deve-se considerar a inclusão desses indicadores para avaliação da segurança dos produtos na atenção primária à saúde. .

OBJETIVOS: adaptar y validar para uso en el ámbito de la APS, por medio de consenso de especialistas, un conjunto de indicadores para evaluación del procesamiento de artículos médicos odontológicos hospitalarios. MÉTODO: estudio metodológico cuantitativo, realizado en dos fases subsecuentes. En la primera fase, un grupo focal fue creado con especialistas con la finalidad de adaptar los indicadores para ser usados en la Atención Primaria de la Salud. En la segunda fase, los indicadores fueron sometidos a validación por los jueces a través de una escala tipo Likert de 4 puntos, considerándose el Índice de Validez de Contenido ≥ 0,75 para aprobación de los indicadores. RESULTADOS: las adaptaciones del grupo focal se refirieron principalmente a la: estructura física, inserción de profesionales de odontología, inclusión de desinfección química y sustitución de métodos de esterilización de calor seco por calor húmedo. La fase de validación resultó en un total de 0,96 de índice para los componentes de los indicadores, variando entre 0,90 y 1,00. CONCLUSIÓN: los indicadores después de la adaptación fueron considerados validados por los jueces. A pesar de que puede haber diferencias entre los productos de procesamiento en todo el mundo, ciertamente características comunes pueden ser encontradas, principalmente en países con ambiente económico y cultural similar. Se debe considerar la inclusión de esos indicadores para evaluar la seguridad de los productos para la salud en la atención primaria. .

Biologia molecular e evolução

O progresso no conhecimento sobre a estrutura do material genético, de sua função no desenvolvimento e na fisiologia dos organismos e de seu papel nos processos evolutivos tem ocorrido num ritmo impressionante e acelerado. Seria espantoso, para alguémformado na década de 1940, por exemplo, comparar o que se sabia então nessa área com o que se sabe hoje em dia. Felizmente, a ciência brasileira, graças a algumas Universidades e a órgãos nacionais e estrangeiros financiadores da atividade científica, está conseguindo acompanhar e participar desse processo. Este livro é uma demonstração dessas considerações. Todos os autores deste livro ensinam e pesquisam no Brasil e tratam em seus capítulos com muita clareza e atualidade de muitos aspectos da evolução e daadaptação dos organismos no nível molecular. Em uma apresentação do livro como um todo, não seria justo salientar este ou aquele aspecto do texto, pois o importante é seu conjunto, próprio de um livro em padrão internacional. Mais justo a fazer é recomendar a sua leitura e o seu estudo a todos os interessados em evolução e, especialmente, no nível molecular.

Biologia molecular e evolução / Molecular biology and evolution

O progresso no conhecimento sobre a estrutura do material genético, de sua função no desenvolvimento e na fisiologia dos organismos e de seu papel nos processos evolutivos tem ocorrido num ritmo impressionante e acelerado. Seria espantoso, para alguémformado na década de 1940, por exemplo, comparar o que se sabia então nessa área com o que se sabe hoje em dia. Felizmente, a ciência brasileira, graças a algumas Universidades e a órgãos nacionais e estrangeiros financiadores da atividade científica, está conseguindo acompanhar e participar desse processo. Este livro é uma demonstração dessas considerações. Todos os autores deste livro ensinam e pesquisam no Brasil e tratam em seus capítulos com muita clareza e atualidade de muitos aspectos da evolução e daadaptação dos organismos no nível molecular. Em uma apresentação do livro como um todo, não seria justo salientar este ou aquele aspecto do texto, pois o importante é seu conjunto, próprio de um livro em padrão internacional. Mais justo a fazer é recomendar a sua leitura e o seu estudo a todos os interessados em evolução e, especialmente, no nível molecular.

Novos objetos e novos desafios para a antropologia da saúde na contemporaneidade / New objects and new challenges for medical anthropology nowadays

O objetivo deste artigo é tecer uma reflexão sobre os objetos emergentes e os desafios teórico-metodológicos e éticos que se apresentam para a antropologia da saúde na contemporaneidade, abordando dois temas em particular: os desafios suscitados pelos avanços da biologia molecular, biotecnologias e medicina preditiva, e a análise da saúde e da doença no contexto de globalização. A antropologia da saúde nos parece chamada a se expandir nos próximos anos em redes temáticas ao redor desses dois grandes eixos centrais: por um lado, as novas definições da doença e da saúde associadas aos avanços das ciências da vida e a forma como o corpo humano é construído, transformado e redefinido como locus da gestão do risco e da incerteza; por outro, o contexto cada vez mais complexo, globalizado e desigual em que estamos vivendo tornam necessária uma abordagem antropológica igualmente mais global, no qual o processo saúde-doença deve ser analisado, cada vez mais dentro de um conjunto complexo de políticas econômicas, de relações internacionais e de mobilidade de populações, através de novas abordagens de pesquisa de natureza transdisciplinar.

This paper aims to reflect on the emerging objects and theoretical, methodological and ethical challenges in contemporary medical anthropology, addressing two issues in particular: the challenged placed by advances in molecular biology, bio-technologies and predictive medicine, and the analysis of health and illness in the context of globalization. Medical anthropology seems to expand in the coming years in thematic networks around these two major centers: on the one hand, the new definitions of disease and health associated with advances in life sciences and how the human body is built, transformed and redefined as the locus of management of risk and uncertainty; on the other, an increasingly complex, globalized and unequal context we are living in make a more global anthropological approach also necessary, in which the health-disease process should be increasingly analyzed within a complex set of economic policies, international relations and mobility of populations through new approaches to interdisciplinary research nature.

Assessment of the scientific-technological production in molecular biology in Brazil (1996-2007): the contribution of genomics programs

Several genome sequencing programs were launched in Brazil by the end of the nineties and the early 2000s.The most important initiatives were supported by the ONSA program (http://watson.fapesp.br/onsa/Genoma3.htm) and aimed at gaining domain in genomic technology and bringing molecular biology to the state of art. Two mainsets of data were collected in the 1996-2007 period to evaluate the results of these genome programs: the scientific production (Scopus and Web of Science databases) and the register of patents (US Patent and Trademark Office), both related to the progress of molecular biology along this period. In regard to the former, Brazil took a great leap in comparison to 17 other developed and developing countries, being only surpassed by China. As to the register of patents in the area of molecular biology, Brazil's performance lags far behind most of the countries focused in the presentstudy, confirming the Brazilian long-standing tendency of poor achievements in technological innovations when compared with scientific production. Possible solutions to surpass this inequality are discussed.

Vários programas de sequenciamento de genoma foram lançados no Brasil no final da década de noventa e início dadécada de 2000. As mais importantes iniciativas foram sustentadas pelo programa ONSA (http://watson.fapesp.br/onsa/Genoma3.htm) e visavam o domínio da tecnologia genômica e o progresso da biologia molecular para o estado da arte desta disciplina. Dois principais conjuntos de dados foram coletados no período de 1996-2007 para avaliar os resultados destes programas de genômica: a produção científica (bases de dados SCOPUS e o registro de patentes (US Patent and Trademark Office), ambos relacionados com o progresso de biologiamolecular ao longo deste período. Em relação ao primeiro o Brasil de um grande passo em comparação a 17 outros países desenvolvidos e em desenvolvimento, sendo apenas superado pela China. Com relação ao registro de patentes na área de biologia molecular, o desempenho do Brasil fica bem atrás entre os países focados no presente estudo, confirmando a perdurável tendência de pobres conquistas em inovação tecnológica, quando comparado com produção científica. São discutidas as possíveis soluções para superar este desequilíbrio.

Biología molecular y cáncer de tiroides / Molecular biology and thyroid cancer

Se realiza una revisión actualizada sobre aspectos de biología molecular que servirán de base al cirujano actuante para un mejor conocimiento del cáncer tiroideo. El objetivo radica en alertar a los cirujanos sobre las nuevas evaluaciones a las que podrán someterse los tumores de la tiroides, que implicarán cambios en toda la gama de conductas actuales en estos casos. Se señalan aspectos que sin duda cambiarán los conceptos que se manejan hoy día(AU)

A updating review is carry out on the features of molecular biology as a basis for acting surgeon to a better knowledge of thyroid cancer. The objective is to alert surgeons on the new assessments for this type of cancer, implicating changes in all the range of current behaviors in these cases. The features that will change the nowadays concepts in this respect(AU)

O corpo gorduroso de Aedes (Stegomyia) aegypti (Diptera; Nematocera) (Linnaeus, 1762): estudo morfológico do órgão em diferentes idades e condições alimentares, isolamento, cultivo primário e transcriptoma dos enócitos

O corpo gorduroso é o principal órgão do metabolismo intermediário dos insetos e a principal fonte de componentes da hemolinfa. Dois tipos celulares estão presentes no corpo gorduroso dos dípteros: os trofócitos e os enócitos. O presente trabalho teve como objetivos testar as seguintes hipóteses: (a) o corpo gorduroso de A. aegypti é capaz de se reorganizar do ponto de vista ultra-estrutural, histoquímico e morfométrico de acordo com a idade e com o tipo de alimentação; (b) os enócitos de A. aegypti podem ser cultivados e (c) os mesmos expressam transcritos relacionados com os processos de desintoxicação, síntese de lipídios e imunidade inata. Para tanto, foram utilizadas fêmeas recém-emergidas, fêmeas com 18d de idade, sendo um grupo 18h e outro quatro dias após a alimentação sangüínea e fêmeas com 18d alimentadas com açúcar. Nas fêmeas alimentadas com açúcar, o corpo gorduroso está mais desenvolvido do que nas pós-mergidas e nas alimentadas com sangue. Nessas mesmas fêmeas, os trofócitos apresentam o citoplasma preenchido basicamente por gotículas de lipídio devido à lipogênese. Após a alimentação sangüínea, os lóbulos do corpo gorduroso estão achatados, o que pode ser explicado pelo esvaziamento do órgão que exporta nutrientes para os ovários. As alterações dos trofócitos após a alimentação sangüínea incluem o aumento do diâmetro nuclear, a diminuição das gotículas de lipídios, o alargamento das mitocôndrias e a presença de lisossomos nos trofócitos. Os enócitos puderam ser mantidos viáveis por 57 dias em cultivo primário e o citoplasma dessas células é quase todo preenchido pelo retículo endoplasmático liso (REL). Os transcritos mais abundantes encontrados nos enócitos correspondem à citocromo P450, responsável pela desintoxicação e às outras proteínas relacionadas com o metabolismo de lipídios.

Também são encontrados transcritos. relacionados com o reconhecimento e de destruição de patógenos. Provavelmente, a presença do REL e a localização periférica dos enócitos no corpo gorduroso de A. aegypti facilita o processo de desintoxicação, a produção e a secreção de lipídios para a hemolinfa, além do reconhecimento de patógenos e da secreção de componentes antimicrobianos. A presença do REL desenvolvido e a expressão de várias enzimas comprometidas com a desintoxicação e o metabolismo de lipídios sugerem que os enócitos participam da homeostasia e síntese lipídica em A. aegypti. Além disso, nossos resultados confirmam o corpo gorduroso de A. aegypti como um órgão capaz de reorganizar sua microanatomia, componentes citoplasmáticos e aspectos subcelulares de acordo com a idade e o tipo de dieta. Também é possível cultivar os enócitos e sua purificação, cultivo primário e transcriptoma constituem importantes ferramentas para que futuros estudos possam investigar a atuação dessas células na fisiologia e na imunidade inata de mosquitos

O corpo gorduroso de Aedes (Stegomyia) aegypti (Diptera; Nematocera) (Linnaeus, 1762): estudo morfológico do órgão em diferentes idades e condições alimentares, isolamento, cultivo primário e transcriptoma dos enócitos / The fat body Aedes (Stegomyia) aegypti (Dipetra; Nematocera) (Linnaeus, 1762): Morphological study of the organ in different ages and diets, isolation, primary culture and the transcriptome of the oenocytes

O corpo gorduroso é o principal órgão do metabolismo intermediário dos insetos e a principal fonte de componentes da hemolinfa. Dois tipos celulares estão presentes no corpo gorduroso dos dípteros: os trofócitos e os enócitos. O presente trabalho teve como objetivos testar as seguintes hipóteses: (a) o corpo gorduroso de A. aegypti é capaz de se reorganizar do ponto de vista ultra-estrutural, histoquímico e morfométrico de acordo com a idade e com o tipo de alimentação; (b) os enócitos de A. aegypti podem ser cultivados e (c) os mesmos expressam transcritos relacionados com os processos de desintoxicação, síntese de lipídios e imunidade inata. Para tanto, foram utilizadas fêmeas recém-emergidas, fêmeas com 18d de idade, sendo um grupo 18h e outro quatro dias após a alimentação sangüínea e fêmeas com 18d alimentadas com açúcar. Nas fêmeas alimentadas com açúcar, o corpo gorduroso está mais desenvolvido do que nas pós-mergidas e nas alimentadas com sangue. Nessas mesmas fêmeas, os trofócitos apresentam o citoplasma preenchido basicamente por gotículas de lipídio devido à lipogênese. Após a alimentação sangüínea, os lóbulos do corpo gorduroso estão achatados, o que pode ser explicado pelo esvaziamento do órgão que exporta nutrientes para os ovários. As alterações dos trofócitos após a alimentação sangüínea incluem o aumento do diâmetro nuclear, a diminuição das gotículas de lipídios, o alargamento das mitocôndrias e a presença de lisossomos nos trofócitos. Os enócitos puderam ser mantidos viáveis por 57 dias em cultivo primário e o citoplasma dessas células é quase todo preenchido pelo retículo endoplasmático liso (REL). Os transcritos mais abundantes encontrados nos enócitos correspondem à citocromo P450, responsável pela desintoxicação e às outras proteínas relacionadas com o metabolismo de lipídios.

Também são encontrados transcritos. relacionados com o reconhecimento e de destruição de patógenos. Provavelmente, a presença do REL e a localização periférica dos enócitos no corpo gorduroso de A. aegypti facilita o processo de desintoxicação, a produção e a secreção de lipídios para a hemolinfa, além do reconhecimento de patógenos e da secreção de componentes antimicrobianos. A presença do REL desenvolvido e a expressão de várias enzimas comprometidas com a desintoxicação e o metabolismo de lipídios sugerem que os enócitos participam da homeostasia e síntese lipídica em A. aegypti. Além disso, nossos resultados confirmam o corpo gorduroso de A. aegypti como um órgão capaz de reorganizar sua microanatomia, componentes citoplasmáticos e aspectos subcelulares de acordo com a idade e o tipo de dieta. Também é possível cultivar os enócitos e sua purificação, cultivo primário e transcriptoma constituem importantes ferramentas para que futuros estudos possam investigar a atuação dessas células na fisiologia e na imunidade inata de mosquitos

Diagnóstico genético preimplantación / Pre-implantation genetic diagnosis

El diagnóstico de múltiples enfermedades, antes de que estas se manifiesten clínicamente y de esta manera lograr tratarlas con gran eficacia y en forma oportuna, incluso antes de nacer. Así surge el concepto de diagnóstico prenatal y con este el de consejo genético. Esto nos lleva a un gran dilema ético porque ¿qué hacemos si podemos diagnosticar los trastornos con los que nacerá el feto si no podemos resolverlos? En 1984, la Organización Mundial de la Salud enfatizó la relevancia de realizar diagnósticos preimplantación como una estrategia preventiva temprana como una opción para parejas con alto riesgo de descendencia con enfermedades genéticas, sin embargo su utilización ha suscitado polémicas bioéticas y legales, con implicaciones en la práctica médica que aquí analizamos.